Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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