Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt9Q6RHW0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms