Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PdgfrlQ6PE55 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PdgfrlQ6PE55 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PdgfrlQ6PE55 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PdgfrlQ6PE55 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PdgfrlQ6PE55 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PdgfrlQ6PE55 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PdgfrlQ6PE55 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PdgfrlQ6PE55 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms