Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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