Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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