Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zbtb40Q6PCS8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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