Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y5

Znf280c, Zinc finger protein 280C, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280cQ6P3Y5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms