Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrimpolQ6P1E7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms