Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms