Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms