Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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NipblQ6KCD5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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NipblQ6KCD5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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NipblQ6KCD5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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