Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms