Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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