Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms