Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms