Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntn4Q69Z26 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn4Q69Z26 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn4Q69Z26 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn4Q69Z26 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn4Q69Z26 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn4Q69Z26 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn4Q69Z26 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn4Q69Z26 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn4Q69Z26 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn4Q69Z26 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn4Q69Z26 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn4Q69Z26 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms