Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q66JV7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q66JV7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q66JV7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q66JV7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q66JV7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q66JV7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q66JV7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q66JV7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q66JV7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q66JV7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q66JV7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q66JV7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q66JV7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q66JV7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms