Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VclQ64727 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VclQ64727 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VclQ64727 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VclQ64727 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VclQ64727 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VclQ64727 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VclQ64727 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VclQ64727 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VclQ64727 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VclQ64727 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VclQ64727 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VclQ64727 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VclQ64727 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VclQ64727 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VclQ64727 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VclQ64727 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VclQ64727 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VclQ64727 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VclQ64727 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VclQ64727 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VclQ64727 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VclQ64727 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VclQ64727 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VclQ64727 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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VclQ64727 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VclQ64727 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VclQ64727 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VclQ64727 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VclQ64727 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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VclQ64727 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VclQ64727 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VclQ64727 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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VclQ64727 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VclQ64727 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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VclQ64727 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VclQ64727 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VclQ64727 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VclQ64727 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VclQ64727 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VclQ64727 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VclQ64727 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VclQ64727 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VclQ64727 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VclQ64727 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VclQ64727 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VclQ64727 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VclQ64727 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VclQ64727 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VclQ64727 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VclQ64727 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VclQ64727 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VclQ64727 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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