Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.3 ms