Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PtprdQ64487 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PtprdQ64487 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PtprdQ64487 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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