Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms