Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfe3Q64092 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms