Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms