Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Hoxa13Q62424 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Hoxa13Q62424 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Hoxa13Q62424 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Hoxa13Q62424 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Hoxa13Q62424 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Hoxa13Q62424 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hoxa13Q62424 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hoxa13Q62424 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hoxa13Q62424 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Hoxa13Q62424 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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