Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3gl2Q62420 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3gl2Q62420 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Sh3gl2Q62420 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms