Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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AtmQ62388 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtmQ62388 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
AtmQ62388 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AtmQ62388 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
AtmQ62388 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AtmQ62388 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AtmQ62388 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AtmQ62388 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AtmQ62388 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
AtmQ62388 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AtmQ62388 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AtmQ62388 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AtmQ62388 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms