Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttf1Q62187 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ttf1Q62187 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ttf1Q62187 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ttf1Q62187 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ttf1Q62187 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ttf1Q62187 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ttf1Q62187 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ttf1Q62187 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ttf1Q62187 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ttf1Q62187 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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