Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msi1Q61474 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms