Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms