Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cln3Q61124 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cln3Q61124 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cln3Q61124 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cln3Q61124 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cln3Q61124 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms