Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms