Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17laQ61068 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms