Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms