Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Caprin1Q60865 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Caprin1Q60865 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Caprin1Q60865 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Caprin1Q60865 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms