Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms