Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms