Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

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Length 1,093 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sema5bQ60519 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sema5bQ60519 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sema5bQ60519 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sema5bQ60519 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5bQ60519 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sema5bQ60519 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms