Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV7

Setd5, SET domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd5Q5XJV7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd5Q5XJV7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd5Q5XJV7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms