Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms