Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Trim38Q5SZ99 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Trim38Q5SZ99 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms