Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brip1Q5SXJ3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brip1Q5SXJ3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms