Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssh2Q5SW75 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms