Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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