Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms