Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms