Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms