Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms