Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trim41Q5NCC3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms