Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ecm2Q5FW85 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms