Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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